Aoi, l’amie de Nene, est désormais prisonnière de l’autre monde. Une triste issue qui pourtant arrange bien Hanako qui voit là un moyen de prolonger l’espérance de vie de Nene et ainsi réaliser son souhait. Le sacrifice d’Aoi entraîne un autre changement à l’école Kamome : une Rupture radicale entre l’au-delà et le monde des vivants entraînant ainsi la disparition de tous les esprits dont Hanako. Nene, dévastée par la perte de ses proches, va recevoir une visite incongrue...

Pour lever la malédiction de la sirène qui la frappait, Nene s’est liée à Hanako. Désormais, elle sera son assistante ! C’est le prix à payer pour son humanité. Mais c’est là le cadet de ses soucis. Un nouveau mystère fait des siennes : le numéro deux, les escaliers Misaki, dont la 4e marche serait un passage vers l’au-delà. Quiconque la foulerait disparaîtrait… pour finir démembré ! Aux côtés de Hanako et Kô Minamoto, un apprenti exorciste ayant juré de rétablir l’ordre dans l’établisseme...

Toujours dans ce monde modifié, Kô et Mitsuba sont conduits inconsciemment dans la Maison Rouge. De leur côté, Nene et ses amis se rendent également dans la bâtisse maudite pour en apprendre plus sur le passé de Hanako et de Tsukasa. En ces lieux maléfiques, la nouvelle vie des élèves de Kamome va se retrouver complètement chamboulée…

La bande de Tsukasa entre en scène afin de tirer les ficelles !Tsukasa envoie Nene dans le territoire de numéro six et lui confie la lourde tâche de détruire le réceptacle de ce dernier qui n’est autre que Sumire. Même s’il semble que ce soit le seul moyen pour qu’elle retourne dans son monde, Nene n’arrive pas à se résoudre à cette issue tragique et préfère partir en quête d’une autre solution. Sumire, de son côté, se retrouve nez à nez avec numéro six après avoir été séparé pendan...

La malédiction de la Maison Rouge s’infiltre peu à peu dans ce monde altéré. Kô a été capturé, et tous les amis de Nene qui l’ont accompagnée dans la maison se retrouvent à leur tour en grand danger. Nene se dirige alors vers la grande horloge de l’école, portant en elle l’ultime lueur d’espoir pour restaurer leur réalité. Seulement, à son arrivée, elle fera une rencontre au poil !

Amane Yugi a enfin avoué qu’il était bel et bien le Hanako du monde réel. Afin d’éviter à Nene le sort tragique qui l’attend, son plan est de l’enfermer pour toujours dans cet univers fictif. Quand la jeune fille l’apprend, elle reste malgré tout déterminée à retourner dans la réalité. Elle décide alors de se tourner vers Shijima, le quatrième mystère de l’école, afin d’obtenir son aide. Mais l’esprit n’apprécie pas que Nene croit pouvoir aller à l’encontre de son destin. Cela lui rappelle...

Mission accomplie ! Il ne reste plus qu’une main à faire disparaître pour que les photos du club de jardinage reviennent à la normale. Mais voilà que la dernière main entraîne Nene à l’intérieur d’un miroir ! De l’autre côté, la jeune assistante fait la rencontre d’un esprit nommé Mitsuba. Ensemble, ils décident de s’allier afin de trouver un moyen de regagner le monde des vivants. Seulement, il semblerait que le maître de cette frontière, ne compte pas les laisser repartir si facilement…

Depuis son retour de l’enfer des miroirs, Kô a le moral dans les chaussettes… Nene, voulant aider son ami à se changer les idées, décide de l’inviter à la fête des étoiles. Accompagnés d’Hanako, ils se rendent à celle organisée dans le monde des esprits, normalement interdite aux humains. Une rumeur raconte sur cet événement que celui qui parvient à écrire son souhait sur les cinq papiers à voeux de couleur différente puis à les accrocher au grand bambou verra son voeu assurément réalisé !...

Alors que la traditionnelle veillée de l’école bat son plein, Aoi se fait enlever par le sixième mystère de l’école, sous le regard impuissant de Nene et Akane ! C es derniers s’élancent immédiatement en quête de leur précieuse amie. Avec tant de mystères de l’école privés de leur pouvoir et alors que l’O-bon, la fête des morts, approche à grand pas, les esprits sont plus instables que jamais. Pour le sixième mystère, Aoi pourrait bien être la clé pour éviter le désastre qui s’annonce à l’...

Un beau matin, Nene découvre que Hanako est son camarade de classe. Tout le monde peut le voir et l’appelle Amane. Il ne flotte plus, on peut le toucher et il dégage même de la chaleur ! En somme, il n’a plus rien d’un fantôme ! Étrangement, elle semble être la seule à trouver cela anormal… Kô, de son côté, rencontre le même problème avec Mitsuba. Les deux amis auraient-ils tout imaginé depuis le début ?

Nene et Hanako ont été séparés depuis la rupture entre le monde des vivants et l’au-delà, mais les voilà enfin réunis ! Il est temps pour la jeune fille de confronter son ami fantôme. De son côté, Kô doit affronter son grand frère pour permettre à ses amis de se retrouver !

L’automne est enfin là, et la fête de la longévité de l’école Kamome arrive à grands pas. Alors que Nene et sa classe se préparent pour leur comédie musicale, quelqu’un essaie de détruire le réceptacle du premier mystère de l’école. Ce qui devait être un joyeux festival tourne alors au cauchemar…